GRETSI'03 19st GRETSI Symposium
on Signal and Image Processing
Paris   8 - 11 september 2003
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Title
La transformation en ondelettes continue : un microscope mathématique adapté à l'étude des propriétés d'invariance d'échelle et de corrélations à longue portée des séquences d'ADN
Author(s)
Alain Arnéodo ENS Lyon
Cédric Vaillant FSB, Lausanne
Benjamin Audit EMBL-EBI, Cambridge
Yves d'Aubenton-Carafa CGM, CNRS, Gif-sur-Yvette
Claude Thermes CGM, CNRS, Gif-sur-Yvette
Rererences
vol. III, page 1
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Abstract

Depuis le début des années 90, l'intérêt des mathématiciens, physiciens et informaticiens pour l'analyse statistique des séquences d'ADN n'a pas cessé de croître. En effet, les immenses progrès de la biologie moléculaire et les grands projets de séquençage ont révélé l'extraordinaire complexité des génomes. Afin de mieux comprendre l'organisation et l'évolution des génomes, il est apparu nécessaire d'introduire de nouveaux concepts et de nouvelles techniques d'analyse du signal. Ainsi, la possibilité que les séquences d'ADN présentent des propriétés d'invariance d'échelle associées à l'existence de corrélations à longue portée (CLP) a été le sujet d'une longue controverse. La raison principale de ce malentendu est le caractère non-stationnaire des séquences d'ADN résultant de l'hétérogénéité de composition des génomes. Cette observation nous a conduits à proposer l'utilisation de la transformation en ondelettes continue (TO) comme outil naturel d'analyse des séquences d'ADN : par un choix adéquat de l'ondelette analysatrice, on peut s'affranchir de la "structure mosaique" de ces séquences et quantifier l'existence de CLP associées à des propriétés d'invariance d'échelle monofractales.
Edition : Télécom-Paris -- 2003