Dans cet article, nous traitons du problème d'imprécision dans l'évaluation de la performance des systèmes instrumentés de sécurité à l'aide des chaînes de Markov floues multi-phases. Les probabilités élémentaires des chaînes de Markov sont remplacées par des nombres flous permettant aux experts fiabilistes d’exprimer leur incertitude dans l’énoncé des valeurs de probabilités de défaillance et autres paramètres des systèmes. Nous montrons comment l'imprécision sur la valeur d’un unique paramètre, ici le taux de couverture de diagnostic, induit des variations particulièrement significatives sur la qualification du niveau d'intégrité de sécurité d'un SIS. Nous montrons également l’intérêt pour le décideur de connaître l’imprécision sur le paramètre de performance servant à qualifier les SIS.